MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 11464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	AAATT	2	10	24	33	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005861	TTAA	2	8	45	52	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005861	AGA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005861	A	6	6	422	427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005861	CTA	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005861	TTA	2	6	811	816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005861	T	6	6	834	839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005861	TTA	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005861	TA	3	6	968	973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005861	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005861	TGAT	2	8	1037	1044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005861	ATA	3	9	4054	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005861	AATT	2	8	4079	4086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005861	TTTG	2	8	4091	4098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005861	ATT	2	6	4121	4126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005861	CCA	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_005861	A	7	7	4143	4149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005861	TC	3	6	4218	4223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005861	ACTTTT	2	12	4240	4251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_005861	AAT	2	6	4294	4299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005861	TTTTC	2	10	4303	4312	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_005861	A	6	6	4352	4357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005861	AG	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005861	ATGA	2	8	8364	8371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005861	TTA	2	6	8446	8451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005861	A	7	7	8519	8525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005861	AAT	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005861	T	6	6	8565	8570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005861	AATT	2	8	8578	8585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005861	AT	3	6	8627	8632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005861	A	6	6	8653	8658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005861	TTCTT	2	10	8740	8749	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_005861	A	6	6	8758	8763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005861	T	7	7	8780	8786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005861	ATA	2	6	8808	8813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005861	A	6	6	8843	8848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005861	A	6	6	8950	8955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005861	ATT	2	6	8975	8980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005861	TAT	2	6	8998	9003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005861	TTC	2	6	9004	9009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005861	GAT	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005861	CTTT	2	8	9346	9353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_005861	TGT	2	6	11110	11115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005861	TTAA	2	8	11198	11205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005861	TAT	2	6	11214	11219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005861	A	7	7	11227	11233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005861	TTC	2	6	11313	11318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_005861	T	6	6	11393	11398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005861	TAT	2	6	11413	11418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005861	ATGG	2	8	11425	11432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005861	TTA	2	6	11456	11461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005861	ATTT	2	8	11483	11490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005861	T	7	7	11504	11510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005861	ATT	2	6	11542	11547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005861	ATT	2	6	11556	11561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005861	T	6	6	11590	11595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005861	ATT	2	6	11611	11616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005861	A	6	6	11649	11654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005861	A	7	7	11717	11723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005861	AAT	2	6	20752	20757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005861	A	6	6	20774	20779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005861	TAAA	2	8	20787	20794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005861	ATTT	2	8	20797	20804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005861	GTT	2	6	20814	20819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005861	TGA	2	6	20828	20833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005861	T	6	6	20870	20875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005861	ATCAA	2	10	20916	20925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_005861	T	7	7	20931	20937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005861	TAAA	2	8	20951	20958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005861	TTA	3	9	21041	21049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005861	T	6	6	21066	21071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005861	T	6	6	21188	21193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005861	CAT	2	6	21209	21214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_005861	AGT	2	6	21274	21279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005861	T	6	6	21358	21363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005861	CAT	2	6	21392	21397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_005861	T	6	6	21408	21413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005861	TAATTA	2	12	23640	23651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005861	TA	3	6	23650	23655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005861	TA	3	6	23680	23685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005861	ATTTT	2	10	23704	23713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005861	TGAA	2	8	23718	23725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005861	A	6	6	23724	23729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005861	TAAT	3	12	23750	23761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005861	AGA	2	6	26599	26604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005861	TCTA	2	8	26618	26625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_005861	A	6	6	26708	26713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005861	GAA	2	6	28068	28073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005861	TGA	2	6	28177	28182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005861	AATA	2	8	28227	28234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005861	ACTG	2	8	28275	28282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_005861	T	6	6	28304	28309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005861	T	7	7	28321	28327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005861	T	6	6	28346	28351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005861	ATT	2	6	28397	28402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005861	TAATT	2	10	28431	28440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005861	T	7	7	28443	28449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005861	A	8	8	28474	28481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005861	TGA	2	6	28515	28520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005861	CGA	2	6	29596	29601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_005861	CTTA	2	8	29612	29619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_005861	A	6	6	29624	29629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005861	AAAT	2	8	29633	29640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005861	ATG	2	6	29667	29672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005861	GCTAT	2	10	29725	29734	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_005861	TCAAA	2	10	29735	29744	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_005861	TTTA	2	8	29748	29755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005861	ATTT	2	8	29773	29780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005861	TCT	2	6	29813	29818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005861	CAAA	2	8	29889	29896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_005861	TTC	2	6	29906	29911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_005861	TAAAT	2	10	32092	32101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005861	ATTTGT	2	12	34746	34757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005861	ATT	2	6	34837	34842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005861	GAG	2	6	34853	34858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005861	TTA	2	6	35893	35898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005861	TAA	2	6	36500	36505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005861	TTC	2	6	36615	36620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005861	TAA	3	9	36627	36635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005861	A	7	7	36644	36650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005861	T	6	6	36672	36677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005861	TAT	2	6	36681	36686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005861	AGA	2	6	37398	37403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005861	TCTT	2	8	37421	37428	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_005861	T	7	7	37427	37433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005861	ATG	2	6	37469	37474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005861	A	7	7	37513	37519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005861	CATT	2	8	37523	37530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_005861	TAAT	2	8	42085	42092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005861	AATT	2	8	42164	42171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005861	TC	3	6	42228	42233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_005861	AATA	2	8	42278	42285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005861	TTTAA	2	10	43119	43128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005861	CTTT	2	8	43180	43187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_005861	AATA	2	8	43201	43208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005861	ATGGCA	2	12	43250	43261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_005861	TGA	2	6	43287	43292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005861	GAA	2	6	43299	43304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005861	T	8	8	43341	43348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005861	A	7	7	43349	43355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005861	ATAA	2	8	43380	43387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005861	ATT	2	6	43440	43445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005861	T	6	6	43444	43449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005861	GCA	2	6	43454	43459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_005861	TAAA	2	8	43478	43485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005861	A	7	7	43483	43489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005861	TAA	2	6	43504	43509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005861	TTA	2	6	43532	43537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005861	GGT	2	6	43546	43551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005861	AAG	2	6	43974	43979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005861	TTC	2	6	43985	43990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_005861	TATAT	2	10	44070	44079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_005861	TTAT	2	8	44085	44092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_005861	TTAAA	2	10	44098	44107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_005861	T	6	6	44129	44134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_005861	TCT	2	6	48356	48361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_005861	ATT	2	6	55851	55856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_005861	T	6	6	55891	55896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_005861	AAT	2	6	117770	117775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_005861	ATT	2	6	117850	117855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_005861	AAG	2	6	117894	117899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NC_005861	CTATT	2	10	118675	118684	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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452	NC_005861	A	6	6	118757	118762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_005861	GA	3	6	118872	118877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_005861	T	6	6	119014	119019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_005861	TTA	2	6	119106	119111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_005861	CTGT	2	8	119146	119153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_005861	ATT	2	6	120319	120324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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